Die BioOptics Facility ist Teil einer umfassenden Forschungskooperation zwischen dem Forschungsinstitut für Molekulare Pathologie GmbH (IMP) und dem Institut für Molekulare Biotechnologie GmbH (IMBA). Sie betreut mehr als 35 Mikroskop Systeme und unterstütz mehr als 250 Wissenschaftlerinnen von der Probenherstellung über die mikroskopische Aufnahme bis zur Bildanalyse.

Derzeit wird das Portfolio der Facility durch den Kauf eines Lichtblatt-Mikroskopsystems erweitert. Dieses soll Aufnahmen von großen Proben bis zu 10 cm gewährleisten.

Ein zentrales Experiment, das mit diesem System durchgeführt werden soll, ist die Aufnahme des Nervensystems, einschließlich Rückenmark und peripherer Nerven, im lebenden Axolotl während des Regenerationsprozesses. Die Visualisierung erfolgt mehrmals, zu verschiedenen Zeitpunkten an demselben Tier. Dazu wird das Tier in Narkoseflüssigkeit auf einer Oberfläche zu fixiert und im Imaging Chamber immobilisiert. Die Bildgebung muss von oben unter Verwendung von Dip-In Objektiven erfolgen.

Weitere geplante Experimente umfassen die Bildgebung lebender Organoide und Gewebeblöcke zur Zellzählung, Zell- und Marker-Lokalisierung und zum Neuron-Tracking und Calcium-Imaging. Die meisten dieser Proben erfordern eine konstante Temperatur von 37 Grad, um die Zellen am Leben zu halten. Daher ist es entscheidend, dass das System beheizt werden kann und eine stabile Temperatur im Imaging Chamber gewährleistet.

Darüber hinaus sollen eine Vielzahl von unterschiedlichen, geklärten Gewebeproben, sowohl von direkten Usern der Facility als auch von deren Kollaborationspartner visualisiert werden. Die Art der Proben, die Clearing-Methoden und die Qualität der Probenvorbereitung variieren erheblich und unterliegen nicht in dem Einfluss der Facility. Daher muss das System in der Lage sein, eine breite Palette von Proben zu verarbeiten und reproduzierbare Bilder mit minimalen Artefakten zu liefern, die in standardisierten Pipelines analysiert werden können. Dies erfordert hochaufgelöste Datensätze nicht nur in der xy-Ebene, sondern auch in der z-Ebene, da eine isotrope Auflösung für ein zuverlässiges und reproduzierbares 3D-Threshholding von entscheidender Bedeutung ist, insbesondere bei Experimenten, die die Zellzählung in großen Volumina zum Ziel haben.

Die verwendeten Clearing-Methoden reichen von organischen Lösungsmitteln bis hin zu wasserbasierten Methoden, wobei wasserbasiertes Clearing besonders empfindlich auf Veränderungen der Dichte und Viskosität des Imagingmediums aufgrund von Temperaturveränderungen im Laufe der Zeit reagieren. Solche Änderungen können den Brechungsindex des Immersionsmediums verändern, was zu einer Verschiebung des Strahls über oder unter die Fokusebene führt.

Das 3i Light-Sheet AxL ist das einzige System, das alle Anforderungen dieser Multi-User Facility mit einer hohen Diversität von Proben und geplanten Experimenten erfüllt. Es verfügt über eine aufrechte Konfiguration mit Dip-In Objektiven, inkludiert Imaging Chambers mit einer Größe bis zu 100 x 30 x 30 mm und ist das einzige System, das thermisch gekoppelte Imaging-chambers mit digitaler Steuerung und Echtzeit-Software-Überwachung der Probenkammer bietet. Dies ermöglicht die notwendige Heizung für lebende sowie eine thermische Stabilität der Probenkammern von +/- 1ºC für geklärte Proben.

Es verwendet zudem eine patentierte und exklusiv lizenzierte Technologie namens Axially Swept Light-Sheet Microscopy (ASLM, US10989661B2 - Originalpublikation K. Dean und R. Fiolka, Opt Express, 2014, Uniform and scalable light-sheets generated by extended focusing https://doi.org/10.1364/OE.22.026141), die es ermöglicht, ein 2,6 Mikrometer dünnes Lichtblatt über ein 10 mm großes Sichtfeld (FOV) zu erzeugen.

Die einzigartige Kombination aus diesem axial gesweeptem Lichtblatt, digital gescanntem Lichtblatt und proprietär entwickelten Anregungsobjektiven (NA 0,14, RI 1,33-1,56) nutzt die volle numerische Apertur der Anregungsobjektive und erzeugt dadurch eine vollständige Verteilung der Beleuchtungswinkel, wodurch Schattenartefakte deutlich minimiert werden. Diese ermöglicht die Aufnahme und Auswertung der Bilder durch Imaging Pipelines in einer Vielzahl von unterschiedlichen Proben inklusive schwieriger, suboptimaler Proben, zum Beispiel durch unvollständiges Clearing oder unterschiedliche optische Dichte der Probe an sich.

Hierbei wird explizit darauf hingewiesen, dass der Auftraggeber nach Veröffentlichung der gegenständlichen Bekanntmachung und der hier angeführten Begründung den Auftrag noch nicht umgehend erteilen wird, sondern vielmehr den Ablauf der Stillhaltefrist von 10 Tagen abwarten wird. Auf Grund dieser Bekanntmachung und gemäß § 356 Abs 8 BVergG 2018 ist dann ein Anfechtungsantrag nach Ablauf einer Frist von 10 Tagen nach der erstmaligen Verfügbarkeit der Bekanntmachung ausgeschlossen. Sofern Fragen zur der hier dargestellten sachlichen Begründung bestehen, gibt darüber hinaus der Auftraggeber unter vergabe@terzaki.at Auskunft.